自動控制是根據(jù)預(yù)先設(shè)定好的參數(shù)來進行操作，不能智能地根據(jù)水質(zhì)水量的變化靈活調(diào)節(jié)工藝參數(shù)，是一種低級的控制。而針對不同的進水有機物和NH3-N濃度以及出水要求，恰當?shù)馗淖兎磻?yīng)時間、HRT、混合液回流比和各池進水流量等工藝參數(shù)，在保證處理水質(zhì)的同時，盡可能減少運行費用，防止污泥膨脹，這是更高層次的計算機過程控制。然而，至今有機物和NH3-N在線檢測傳感器還沒有問世，無法根據(jù)池中的有機物和NH3-N濃度降解情況控制相應(yīng)的參數(shù)[40]。目前大多數(shù)研究人員使用氧化還原電位（ORP）、好氧速率（OUR）、溶解氧濃度（DO）和pH值等這些價格便宜、精度高、又便于與計算機接口的儀器實現(xiàn)廢水生物處理的自動控制。
實現(xiàn)高級控制就是要在進水COD和NH3-N濃度無規(guī)律大幅度變化的情況下，根據(jù)特性曲線、數(shù)學(xué)模型、有關(guān)規(guī)則和測定值等對各處理單元的工藝控制過程和參數(shù)進行系統(tǒng)分析和表達，利用人的知識和經(jīng)驗以及新的研究成果讓計算機模擬人腦進行控制，進而完成其它控制方式無法處理的信息，實現(xiàn)智能化控制，保證處理水質(zhì)，又能節(jié)約能源，盡可能的縮短處理周期，使設(shè)備運行在比較佳狀態(tài)。
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